span6 + span5 = 11, daher ist rechts noch eine Spalte übrig, es muss beim 12er-Raster natürlich immer aufgefüllt werden.
Der Abstand kann bei Bootstrap 2 mit einem bereits fix berechneten Grid (bootstrap.css bzw. bootstrap.min.css) nicht mehr so einfach und nur durch Überschreiben geändert werden. Die saubere, aber auch zeitaufwändigere Lösung wäre hier, Boostrap 2 per Less-Kompiler neu zu berechnen, wobei Breiten und Abstände in der variables.less eingestellt werden.