Erstens: die Joomla 3.x wird nach Erscheinen der 4.0 noch mindestens zwei Jahre weiter supportet.
Zweitens: Was in Joomla 3.x sauber (!!) programmiert ist läuft auch auf v4.0 - hier weiss ich natürlich nicht, wie es bei deinen Extensions aussieht.
Der große Unterschied liegt darin dass nun Bootstrap Version 4 im Einsatz ist. Templates, die rein auf bootstrap Version 2 aufsetzen werden also angepasst werden müssen - und wenn nur dadurch dass die alte Boostrap Version eingebunden wird.
Ich würde also ganz entspannt auf Version 4 warten. Aber trotzdem alles was nicht gebraucht wird umgehend von der Seite entfernen, unabhängig von allem anderen.