Hi davenant,
eigentlich könnte man besser helfen wenn man einen Link zur Seite hätte.
Ich versuche zu erkennen was Du erreichen möchtest.
Du kannst im Helix auch Deine eigene Bootstrap 12 er Aufteilung eingeben solange die Reihe 12 ergibt.
z.B. 2-2-2-2-2-2 oder so.
Welches Basis Layout für den Header benutzt Du denn ?
Die inneren Rahmenabstände kannst Du in Deiner custom.css mit padding-left usw. setzen, ich nehme meist sowas wie padding: 10px;