So, ich bin auf des Rätsels Lösung an anderer Stelle gestoßen:
(http://www.joomlaportal.de/joo…tionieren-nicht-mehr.html)
Der entscheidende Punkt war die Datenbank zu "reparieren"
(2. Im Backend auf "Erweiterungen (Extensions) -> Verwalten (Extension Manager) -> Links auf Datenbank (Database) und oben auf reparieren klicken.)
Nun werden auch wieder alle updates angezeigt.